西部縱貫線北段：(基隆~竹南，共29站)
基隆、三坑、八堵、七堵、百福、五堵、汐止、汐科、南港、松山、台北、萬華、板橋、樹林、山佳、鶯歌、桃園、內壢、中壢、埔心、楊梅、富岡、湖口、新豐、竹北、新竹、香山、崎頂、竹南

 

西部縱貫線山線：(竹南~彰化，共18站)
竹南、造橋、豐富、苗栗、南勢、銅鑼、三義、泰安、后里、豐原、潭子、太原、台中、大慶、烏日、新烏日、成功、彰化

 

 

西部縱貫線海線：(竹南~彰化，共18站)
竹南、談文、大山、後龍、龍港、白沙屯、新埔、通霄、苑裡、日南、大甲、台中港、清水、沙鹿、龍井、大肚、追分、彰化

 

西部縱貫線南段：(彰化~高雄，共41站)
彰化、花壇、大村、員林、永靖、社頭、田中、二水、林內、石榴、斗六、斗南、石龜、大林、民雄、嘉北、嘉義、水上、南靖、後壁、新營、柳營、林鳳營、隆田、拔林、善化、南科、新市、永康、大橋、台南、保安、中洲、大湖、路竹、岡山、橋頭、楠梓、新左營、左營、高雄

 

屏東線：(高雄~枋寮，共18站)
高雄、鳳山、後庄、九曲堂、六塊厝、屏東、歸來、麟洛、西勢、竹田、潮州、崁頂、南州、鎮安、林邊、佳冬、東海、枋寮

 

南迴線：(枋寮~台東，共12站)
枋寮、加祿、內獅、枋山、古莊、大武、瀧溪、金崙、太麻里、知本、康樂、台東

 

宜蘭線：(八堵~蘇澳，共27站)
八堵、暖暖、四腳亭、瑞芳、侯硐、三貂嶺、牡丹、雙溪、貢寮、福隆、石城、大里、大溪、龜山、外澳、頭城、頂埔、礁溪、四城、宜蘭、二結、中里、羅東、冬山、新馬、蘇澳新站、蘇澳

 

北迴線：(蘇澳新站~花蓮，共13站)
蘇澳新站、永樂、東澳、南澳、武塔、漢本、和平、和仁、崇德、新城、景美、北埔、花蓮

 

台東線：(花蓮~台東，共28站)
花蓮、吉安、志學、平和、壽豐、豐田、溪口、南平、鳳林、萬榮、光復、大富、富源、瑞穗、三民、玉里、東里、東竹、富里、池上、海端、關山、月美、瑞和、瑞源、鹿野、山里、台東

 

平溪支線：(三貂嶺~菁桐，共7站)
三貂嶺、大華、十分、望古、嶺腳、平溪、菁桐

 

內灣支線：(新竹~內灣，共10站)
新竹、竹中、上員、榮華、竹東、橫山、九鑽頭、合興、富貴、內灣

 

集集支線：(二水~車埕，共7站)
二水、源泉、濁水、龍泉、集集、水里、車埕